Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms