Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpaQ62189 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms