Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Odf1Q61999 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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