Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AtrxQ61687 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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