Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli3Q61602 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms