Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms