Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms