Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ncor1Q60974 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncor1Q60974 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ncor1Q60974 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ncor1Q60974 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ncor1Q60974 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ncor1Q60974 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ncor1Q60974 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ncor1Q60974 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ncor1Q60974 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ncor1Q60974 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms