Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a4Q60857 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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