Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3Q60803 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms