Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms