Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Tnfaip3Q60769 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms