Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SkiQ60698 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms