Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms