Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prdm1Q60636 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms