Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpa6Q5U901 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms