Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rabl6Q5U3K5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabl6Q5U3K5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms