Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam71bQ5STT6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms