Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AbrQ5SSL4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AbrQ5SSL4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms