Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Bhlha9Q5RJB0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms