Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarf1Q5ND28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms