Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SynaQ5G5D5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms