Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms