Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Urb1Q571H0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Urb1Q571H0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Urb1Q571H0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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