Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1810049J17RikQ3V2G9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1810049J17RikQ3V2G9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms