Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk4Q3V129 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms