Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3V0E1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms