Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc160Q3UYG1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms