Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms