Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm10Q3UTQ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms