Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms