Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UPC7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UPC7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UPC7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UPC7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms