Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms