Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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