Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf44Q3UHJ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms