Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms