Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LchnQ3UHG7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LchnQ3UHG7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms