Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms