Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Puf60Q3UEB3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms