Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf149Q3U2C5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf149Q3U2C5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms