Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Palb2Q3U0P1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms