Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hace1Q3U0D9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms