Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TQQ9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms