Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CiartQ3TQ03 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms