Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc102aQ3TMW1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms