Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms