Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms