Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RubcnlQ3TD16 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms