Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms