Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riiad1Q3KNY5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms